Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP10Q15642 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP10Q15642 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIP10Q15642 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP10Q15642 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP10Q15642 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP10Q15642 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP10Q15642 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIP10Q15642 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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