Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms