Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3A1Q15459 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A1Q15459 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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