Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3GAP1Q15042 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3GAP1Q15042 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
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