Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPBGQ13641 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TPBGQ13641 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPBGQ13641 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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