Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TROQ12816 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TROQ12816 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TROQ12816 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TROQ12816 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TROQ12816 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TROQ12816 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TROQ12816 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TROQ12816 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TROQ12816 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TROQ12816 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TROQ12816 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TROQ12816 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TROQ12816 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TROQ12816 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TROQ12816 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TROQ12816 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TROQ12816 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TROQ12816 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TROQ12816 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TROQ12816 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TROQ12816 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TROQ12816 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TROQ12816 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TROQ12816 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TROQ12816 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TROQ12816 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TROQ12816 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TROQ12816 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TROQ12816 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TROQ12816 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TROQ12816 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TROQ12816 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TROQ12816 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TROQ12816 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TROQ12816 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
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