Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 YGR269WYGR269W 327 nt4.97□□□□□ -1.61
SMC6Q12749 SRN2YLR119W 642 nt4.97□□□□□ -1.61
SMC6Q12749 YMR315WYMR315W 1050 nt4.97□□□□□ -1.61
SMC6Q12749 TSL1YML100W 3297 nt4.97□□□□□ -1.61
SMC6Q12749 NNK1YKL171W 2787 nt4.97□□□□□ -1.61
SMC6Q12749 POL12YBL035C 2118 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 AKL1YBR059C 3327 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 IKS1YJL057C 2004 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YMR111CYMR111C 1389 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YIL165CYIL165C 360 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 DBR1YKL149C 1218 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLL017WYLL017W 312 nt4.96□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 HRK1YOR267C 2280 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 MSC2YDR205W 2175 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 MST1YKL194C 1389 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 GPP1YIL053W 753 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 CYC1YJR048W 330 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ACP1YKL192C 378 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YKR075CYKR075C 924 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SET6YPL165C 1122 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPR071WYPR071W 636 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPL260WYPL260W 1656 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ORC6YHR118C 1308 nt4.95□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 CEG1YGL130W 1380 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 TYW1YPL207W 2433 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ICY2YPL250C 411 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 REI1YBR267W 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 PHO12YHR215W 1404 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 PHO11YAR071W 1404 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SSH4YKL124W 1740 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 MSE1YOL033W 1611 nt4.94□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SBE2YDR351W 2595 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YDR274CYDR274C 372 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YFL068WYFL068W 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ERV14YGL054C 417 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 FRA2YGL220W 363 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YKR047WYKR047W 306 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 PSR1YLL010C 1284 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ELO3YLR372W 1038 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SPS19YNL202W 879 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 HMT1YBR034C 1047 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 PEP4YPL154C 1218 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 STR2YJR130C 1920 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 TGL4YKR089C 2733 nt4.93□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SAC1YKL212W 1872 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 DPH6YLR143W 2058 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YDL124WYDL124W 939 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 RIP1YEL024W 648 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 CAF16YFL028C 870 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YGR016WYGR016W 573 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YGR079WYGR079W 1113 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 FMP33YJL161W 543 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 LSO1YJR005C-A 282 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YNK1YKL067W 462 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YRA2YKL214C 612 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YAR023CYAR023C 540 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YLR402WYLR402W 192 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 BUD17YNR027W 954 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPR015CYPR015C 744 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ANT1YPR128C 987 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YBR219CYBR219C 384 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 TPO2YGR138C 1845 nt4.92□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 PRP28YDR243C 1767 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 DAS2YDR020C 699 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 BUR6YER159C 429 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 RFC2YJR068W 1062 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 RFU1YLR073C 603 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 RPS31YLR167W 459 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YPL278CYPL278C 303 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 ZPR1YGR211W 1461 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 GRC3YLL035W 1899 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 SIR1YKR101W 1965 nt4.91□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 FMP30YPL103C 1407 nt4.9□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 TCM62YBR044C 1719 nt4.9□□□□□ -1.62
SMC6Q12749 YNL057WYNL057W 333 nt4.9□□□□□ -1.63
SMC6Q12749 ARC40YBR234C 1155 nt4.9□□□□□ -1.63
SMC6Q12749 BSD2YBR290W 966 nt4.9□□□□□ -1.63
SMC6Q12749 SUL2YLR092W 2682 nt4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32 ms