Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms