Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms