Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms