Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP4Q07065 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms