Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC10Q01780 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms