Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms