Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BEX3Q00994 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms