Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM2Q00987 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MDM2Q00987 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms