Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDLBPQ00341 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDLBPQ00341 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms