Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP11AP98196 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP11AP98196 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms