Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG7P83436 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG7P83436 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG7P83436 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG7P83436 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG7P83436 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG7P83436 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG7P83436 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG7P83436 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG7P83436 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG7P83436 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG7P83436 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG7P83436 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG7P83436 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG7P83436 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG7P83436 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG7P83436 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms