Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL7P80098 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL7P80098 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL7P80098 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCL7P80098 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCL7P80098 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL7P80098 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL7P80098 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms