Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCCD1P59942 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms