Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP9P55211 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP9P55211 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP9P55211 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP9P55211 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP9P55211 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP9P55211 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms