Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NAP1L1P55209 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L1P55209 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms