Protein–RNA interactions for Protein: P53259

PCP1, Rhomboid protein 1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCP1	P53259	GAT3	YLR013W	426 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YIF1	YNL263C	945 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	CDC28	YBR160W	897 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YMR1	YJR110W	2067 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	UBA1	YKL210W	3075 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	TSL1	YML100W	3297 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.15	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	ELP2	YGR200C	2367 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	snR32	snR32	188 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	ATM1	YMR301C	2073 nt		4.14	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YDR336W	YDR336W	945 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	PAD1	YDR538W	729 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	UPS2	YLR168C	693 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RAD10	YML095C	633 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	CLB5	YPR120C	1308 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.13	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YLR125W	YLR125W	411 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YOR342C	YOR342C	960 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.12	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SCS2	YER120W	735 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YER187W	YER187W	426 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SDT1	YGL224C	843 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YJL220W	YJL220W	453 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	POL12	YBL035C	2118 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YMR178W	YMR178W	825 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SSP2	YOR242C	1116 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	NGL3	YML118W	1518 nt		4.11	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	NTH2	YBR001C	2343 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	WSS1	YHR134W	810 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	PSY3	YLR376C	729 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YOL166C	YOL166C	339 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	BUB3	YOR026W	1026 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MAK3	YPR051W	531 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SKG3	YLR187W	3081 nt		4.1	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YNL095C	YNL095C	1929 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MSS2	YDL107W	1056 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	DAS2	YDR020C	699 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RPC17	YJL011C	486 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	RPP0	YLR340W	939 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	CPR3	YML078W	549 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	CTL1	YMR180C	963 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MED7	YOL135C	669 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SHE3	YBR130C	1278 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.09	□□□□□ -1.75
PCP1	P53259	YFT2	YDR319C	825 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	PAL1	YDR348C	1500 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	AUA1	YFL010W-A	285 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	ACT1	YFL039C	1128 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	SUT1	YGL162W	900 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	DID4	YKL002W	699 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	RRN3	YKL125W	1884 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	ERD2	YBL040C	660 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	AIF1	YNR074C	1137 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	COX11	YPL132W	903 nt		4.08	□□□□□ -1.76
PCP1	P53259	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.08	□□□□□ -1.76

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