Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ME1P48163 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME1P48163 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ME1P48163 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ME1P48163 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME1P48163 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME1P48163 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME1P48163 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME1P48163 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME1P48163 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME1P48163 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME1P48163 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME1P48163 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME1P48163 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME1P48163 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME1P48163 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ME1P48163 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ME1P48163 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME1P48163 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms