Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS9P46781 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS9P46781 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS9P46781 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS9P46781 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS9P46781 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS9P46781 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS9P46781 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS9P46781 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS9P46781 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS9P46781 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS9P46781 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS9P46781 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms