Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL21P46778 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL21P46778 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL21P46778 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL21P46778 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL21P46778 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms