Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSOP43234 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSOP43234 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSOP43234 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSOP43234 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSOP43234 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms