Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGFRP43088 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms