Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCIP41743 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms