Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms