Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC1P35251 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC1P35251 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC1P35251 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC1P35251 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC1P35251 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC1P35251 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC1P35251 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms