Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA4P35212 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA4P35212 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA4P35212 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA4P35212 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA4P35212 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA4P35212 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA4P35212 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms