Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP2P32456 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP2P32456 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP2P32456 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP2P32456 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP2P32456 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP2P32456 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP2P32456 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBP2P32456 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP2P32456 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP2P32456 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP2P32456 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP2P32456 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP2P32456 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP2P32456 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms