Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms