Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLIP1P30622 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms