Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBMS1P29558 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms