Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms