Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARF4P18085 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARF4P18085 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF4P18085 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF4P18085 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF4P18085 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF4P18085 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARF4P18085 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARF4P18085 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARF4P18085 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms