Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2A2P16615 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms