Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6AP16499 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms