Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG1P15918 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAG1P15918 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAG1P15918 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG1P15918 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG1P15918 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAG1P15918 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RAG1P15918 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAG1P15918 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms