Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1P11387 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1P11387 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1P11387 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1P11387 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1P11387 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1P11387 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1P11387 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1P11387 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP1P11387 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms