Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSLP07711 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSLP07711 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSLP07711 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSLP07711 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CTSLP07711 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSLP07711 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSLP07711 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms