Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB1P05937 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB1P05937 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB1P05937 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB1P05937 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB1P05937 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB1P05937 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB1P05937 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB1P05937 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB1P05937 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB1P05937 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALB1P05937 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALB1P05937 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB1P05937 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms