Protein–RNA interactions for Protein: P01135

TGFA, Protransforming growth factor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFAP01135 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGFAP01135 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGFAP01135 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFAP01135 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFAP01135 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms