Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DEPDC5O75140 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms