Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSCO60682 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSCO60682 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSCO60682 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSCO60682 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSCO60682 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSCO60682 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSCO60682 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MSCO60682 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSCO60682 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSCO60682 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MSCO60682 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSCO60682 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSCO60682 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSCO60682 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSCO60682 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSCO60682 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSCO60682 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSCO60682 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSCO60682 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSCO60682 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSCO60682 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSCO60682 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms