Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
KIAA0556O60303 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
KIAA0556O60303 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms