Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFA2T2O43439 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFA2T2O43439 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms