Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP290O15078 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP290O15078 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP290O15078 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP290O15078 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP290O15078 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP290O15078 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP290O15078 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP290O15078 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP290O15078 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP290O15078 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP290O15078 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP290O15078 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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